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1976
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1975
Esparsos, volumes II e III, Coimbra, Universidade.
1974
"A "Carta de marear" em 1487, entregue por D. João II a Pêro da Covilhã" in Memórias da Academia de Ciências de Lisboa, Classe de Ciências, t. 17, Lisboa, [s. n.], pp. 165-175 (with offprint).
Esparsos, vol. I, Coimbra, Universidade.
1973
"O descobrimento de Porto Santo e da Madeira e o infante D. Henrique", separata da Revista da Universidade de Coimbra, vol. 23, Coimbra.
"A história do descobrimento das ilhas da Madeira por Roberto Machim em fins do século XIV / The story of Robert Machin's discovery of the Madeira islands late in the XIV century", separata da Revista da Universidade de Coimbra, vol. 23, Coimbra.
O mistério de Vasco da Gama, Lisboa - Coimbra, Junta de Investigações do Ultramar (English edition available).
D. João II e o Tratado de Tordesilhas, Lisboa, Junta de Investigações do Ultramar.
1972
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1971
Curso de História da Cartografia e da Naútica (co-authored by Luís de Albuquerque), Coimbra, Universidade de Coimbra.
Descobrimento e cartografia das Ilhas de São Tomé e Príncipe, Coimbra, Junta de Investigações do Ultramar.
History of portuguese cartography : history of astronomical navigation (co-authored by Luís de Albuquerque), Lisboa, Junta de Investigação do Ultramar.
Obras Completas de D. João de Castro (critical edition by Armando Cortesão and Luís de Albuquerque), vol. II, Coimbra, Academia Internacional de Cultura Portuguesa.
1970
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"Pizzigano's chart of 1424", separata da Revista da Universidade de Coimbra, vol. 24, Coimbra.
1969
Arte de Navegar de Manuel Pimentel (comments and notes by Armando Cortesão, Fernanda Aleixo, Luís de Albuquerque), Lisboa, Junta de Investigações do Ultramar.
Curso de História da Cartografia Portuguesa para estudantes e pós-graduados, Coimbra, Imprensa de Coimbra.
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O livro de marinharia de Manuel Álvares (edição de Luís de Albuquerque e prefácio de Armando Cortesão), Lisboa, Junta de Investigações do Ultramar.
1968
Obras Completas de D. João de Castro (critical edition by Armando Cortesão and Luís de Albuquerque), vol. I, Coimbra, Academia Internacional de Cultura Portuguesa.
1966
"O maior serviço internacional da cultura portuguesa" in Boletim da Academia Internacional da Cultura Portuguesa, nº 1, pp. 13-28.
"O problema da origem da carta portulano", separata de Revista da Faculdade de Ciências, vol. 39, Coimbra.
1965
Os Guias náuticos de Munique e Évora (edited by Luís de Albuquerque, preface by Armando Cortesão), Lisboa, Junta de Investigações do Ultramar.
"A mais antiga carta corográfica de Portugal manuscrita de que há conhecimento" in Ethnos, vol. IV, Lisboa, Instituto Português de Arqueologia, História e Etnografia, pp. 95-99 (with offprint).
1964
"Cartografia portuguesa e a geografia de Ptolomeu", separata de Boletim da Academia das Ciências de Lisboa, vol. 36, Lisboa.
"A propósito do ilustre boticário quinhentista Tomé Pires", separata de Boletim da Escola de Farmácia, vol. 23, Coimbra.
1963
Luís de Albuquerque, O Livro de marinharia de André Pires (introduction by Armando Cortesão), Lisboa, Junta de Investigações do Ultramar.
"Curso de História da Cartografia" (co-authored by Luís de Albuquerque e Avelino Teixeira da Mota) in Boletim do Centro de Estudos Geográficos, vol. 3, nº 20, Coimbra, Instituto de Alta Cultura, pp. 139-190 (with offprint).
1962
"Do ambiente científico em que se iniciaram os descobrimentos portugueses", separata de O Instituto, Coimbra.
Estudos sobre a história da cartografia antiga / Studies on the history of early cartography (compilation by Armando Cortesão e A. Teixeira da Mota), edição bilingue, Coimbra, Imprensa de Coimbra.
Realidades e desvarios africanos, Lisboa, Sociedade de Geografia de Lisboa (editions in English, French and Spanish: Lisboa, Agência Geral do Ultramar, 1962).
1961
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1960
Boies Penrose, Goa - rainha do Oriente / Goa - queen of the East (introduction by Armando Cortesão), Lisboa, Comissão Ultramarina.
Tabularum geographicarum lusitanorum specimen (co-authored by Avelino Teixeira da Mota), Lisboa, Comissão para as comemorações do V centenário da morte do infante D. Henrique.
Cartografia portuguesa antiga, Lisboa, Comissão Executiva das Comemorações do V Centenário da Morte do Infante D. Henrique.
Portugaliae monumenta cartographica (co-authored by Avelino Teixeira da Mota), 6 volumes, Lisboa, Comissão para as Comemorações do V Centenário da Morte do Infante D. Henrique (fac-simile, introduction by Alfredo Pinheiro Marques, 7 volumes, Lisboa, Imprensa Nacional - Casa da Moeda, 1987).
1954
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Note on the Castiglioni planisphere, Leiden, E. J. Brill.
1953
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1951
"La découverte de l'Amérique et la science nautique" in Les conséquences de la découverte de l'Amérique par Christophe Colomb, Paris, Université de Paris, pp. 25-38.
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"A ciência náutica e o renascimento" in Seara Nova, vol. 11, nº 36-37, Lisboa, pp. 198-202 (English edition in Archives Internationales d'Histoire des Sciences, 9, Paris, J. Peyronnet, 1949, with offprint).
1945
Primeira embaixada europeia à China: o boticário e embaixador Tomé Pires e a sua "Suma Oriental", Lisboa, Gráfica Lisbonense (revised edition by João Carvalho: bilingual Portuguese and Chinese, Macau, Instituto Cultural, 1990).
1944
The Suma Oriental of Tomé Pires: an account of the East, from the Red Sea to Japan written in Malacca and India in 1512-1515. The book of Francisco Rodrigues : rutter of a voyage in the Red sea, nautical rules, almanack and maps, written and drawn in the East before 1515 (translated and edited by Armando Cortesão), 2 volumes, Londres, The Hakluyt Society (Portuguese edition: Coimbra, Por Ordem da Universidade, 1978).
A "cidade de Bengala" do século XVI e os portugueses, Lisboa, Tipografia da Sociedade Astória.
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"António Pereira and his map of Circa 1545 : an unknown Portuguese cartographer and the early representation of Newfoundland, Lower California, the Amazon and the Ladrones" in Geographical Review, v. 29, nº 2, Nova Iorque, American Geographical Society, pp. 205-225 (with offprint).
"O descobrimento da Australásia e a «Questão das Molucas»" in História da Expansão Portuguesa no Mundo (dir. António Baião, Hernâni Cidade, Manuel Múrias), volume II, Lisboa, Ática, pp. 129-150.
"A expansão portuguesa através do Pacífico (Austrália, Macau, Japão)" in História da Expansão Portuguesa no Mundo (dir. António Baião, Hernâni Cidade, Manuel Múrias), volume II, Lisboa, Ática, pp. 151-173.
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Carta das novas que vieram a el rei nosso senhor do descobrimento do Preste João, (Lisboa 1521) (colaboration with Thomas Henry), Lisboa, Bertrand (English edition: Londres, British Museum, 1938).
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Cartografia e Cartógrafos Portugueses dos séculos XV e XVI: contribuição para um estudo completo, 2 volumes, Lisboa, Seara Nova.
"Espionagem dos descobrimentos" in Vida Contemporânea, nº 18, Lisboa.
1932
Os Homens: cartógrafos portugueses do século XVI, Coimbra, Imprensa da Universidade.
1931
"Subsídios para a história do descobrimento da Guiné e Cabo Verde" in Boletim da Agência Geral das Colónias, nº 76, Lisboa, pp. 3-39 (with offprint).
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"A Guiné como colónia de comércio e de plantação" in Boletim da Agência Geral das Colónias, n.º 37, pp. 3-78.